梅澤 公二 (ウメザワ コウジ)   

学術研究院(農学系)

先鋭領域融合研究群 バイオメディカル研究所 

助教 

学位

  • 博士(理学), 大阪大学
  • 修士(生命科学), 東京薬科大学

研究キーワード

    理論生物学・バイオインフォマティクス

研究分野

  • 生物物理学, 生物物理学

経歴

  • 2016年
    信州大学総合理工学研究科 生命医工学専攻・助教(特定雇用)
  • 2013年 - 2016年
    早稲田大学理工学術院・日本学術振興会 特別研究員PD
  • 2011年 - 2013年
    早稲田大学理工学術院先進理工学・次席研究員

学歴

  • 2011年, 大阪大学, 生命機能研究科, 生命機能専攻
  • 2008年, 東京薬科大学, 生命科学研究科, 生命科学専攻
  • 2006年, 東京薬科大学, 薬学部, 製薬学科

論文

  • Development of the 12-base short dimeric myogenetic oligodeoxynucleotide that induces myogenic differentiation.
    Umezawa K, Ikeda R, Sakamoto T, Enomoto Y, Nihashi Y, Shinji S, Shimosato T, Kagami H, Takaya T.
    BioTech, 13(2), 11, 2024年, 査読有りリポジトリ電子ジャーナル
  • Myogenetic oligodeoxynucleotide induces myocardial differentiation of murine pluripotent stem cells.
    Ishioka M, Nihashi Y, Sunagawa Y, Umezawa K, Shimosato T, Kagami H, Morimoto T, Takaya T.
    Int J Mol Sci, 24(18), 14380, 2023年, 査読有りリポジトリ電子ジャーナル
  • Identification of a novel osteogenetic oligodeoxynucleotide (osteoDN) that promotes osteoblast differentiation in a TLR9-independent manner.
    Nihashi Y, Miyoshi M, Umezawa K, Shimosato T, Takaya T.
    Nanomaterials, 12(10), 1680, 2022年05月14日, 査読有りリポジトリ電子ジャーナル
  • Myogenetic oligodeoxynucleotide complexed with berberine promotes differentiation of chicken myoblasts.
    Nihashi Y, Shinji S, Umezawa K, Shimosato T, Ono T, Kagami H, Takaya T
    ANIMAL SCIENCE JOURNAL, 92(1), e13597, 2021年07月25日, 査読有りリポジトリ電子ジャーナル
  • Identification of the myogenetic oligodeoxynucleotides (myoDNs) that promote differentiation of skeletal muscle myoblasts by targeting nucleolin
    Shinji S, Umezawa K, Nihashi Y, Nakamura S, Shimosato T, Takaya T.
    Frontiers in Cell and Developmental Biology, 8, 616706, 2021年01月, 査読有りリポジトリ電子ジャーナル
  • Hyperstable De Novo Protein with a Dimeric Bisecting Topology
    Kimura N., Mochizuki K., Umezawa K., Hecht MH., Arai R.
    ACS Synthetic Biology, 9(2), 254-259, 2020年01月17日電子ジャーナル
  • Berberine and palmatine inhibit the growth of human rhabdomyosarcoma cells.
    Shinji, S; Nakamura, S; Nihashi, Y; Umezawa, K; Takaya, T
    Biosci Biotechnol Biochem, 84(1), 63-75, 2020年, 査読有りWebofScienceリポジトリ電子ジャーナル
  • Distinct cell proliferation, myogenic differentiation, and gene expression in skeletal muscle myoblasts of layer and broiler chickens
    Nihashi Y, Umezawa K, Shinji S, Hamaguchi Y, Kobayashi H, Kono T, Ono T, Kagami H, Takaya T
    SCIENTIFIC REPORTS, 9, 16527, 2019年11月11日, 査読有りWebofScienceリポジトリ電子ジャーナル
  • Synthesis of epigallocatechin trimer, (epigallocatechin)2-epicatechin, and (epigallocatechin)2-catechin via a Lewis acid mediated one-pot condensation and their antitumor activities in prostate cancer cells.
    Ichikawa M, Yamamoto S, Ishihara C, Nonobe S, Hattori Y, Umezawa K, Fujii H, Makabe H
    Tetrahedron, 74(27), 3534-3542, 2018年07月05日, 査読有り
  • Structural and dynamical characteristics of tropomyosin epitopes as the major allergens in shrimp.
    Ozawa H, Umezawa K, Takano M, Ishizaki S, Watabe S, Ochiai Y
    Biochemical and biophysical research communications, 498(1), 2018年03月25日, 査読有り
  • Epicatechin oligomers longer than trimers have anti-cancer activities, but not the catechin counterparts
    Takanashi K, Suda M, Matsumoto K, Ishihara C, Toda K, Kawaguchi K, Senga S, Kobayashi N, Ichikawa M, Katoh M, Hattori Y, Kawahara S, Umezawa K, Fujii H, and Makabe H
    SCIENTIFIC REPORTS, 7(1), 7791, 2017年08月10日, 査読有り
  • Over-Destabilization of Protein-Protein Interaction in Generalized Born Model and Utility of Energy Density Integration Cutoff
    Mizuhara Y, Parkin D, Umezawa K, Ohnuki J, Takano M
    JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B, 121, 4669-4677, 2017年04月20日, 査読有り
  • 分子動力学シミュレーションで探る天然変性タンパク質の準安定複合体構造と結合解離調節機構
    梅澤公二
    信州大学農学部紀要, 53, 34-43, 2017年03月21日リポジトリ
  • Intrinsic disorder accelerates dissociation rather than association
    Koji Umezawa, Jun Ohnuki, Junichi Higo, Mitsunori Takano
    Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics, -(-), 2016年05月18日, 査読有り電子ジャーナル
  • Enhanced sampling simulations to construct free-energy landscape of protein–partner substrate interaction
    Jinzen Ikebe, Koji Umezawa, Junichi Higo
    Biophysical Reviews, 8(1), 45-62, 2016年01月11日, 査読有り電子ジャーナル
  • 全原子コンピュータシミュレーションで解き明かす,天然変性蛋白 質の分子認識機構
    肥後順一, 梅澤公二
    生物物理, 54(2), 096-099, 2014年04月, 査読有り電子ジャーナル
  • virtual-system coupled multicanonical molecular dynamics simulation: Principles and applications to free-energy landscape of protein–protein interaction with an all-atom model in explicit solvent
    Junichi Higo, Koji Umezawa, Haruki Nakamura
    The Journal of Chemical Physics, 138, 184106, 2013年05月10日, 査読有り電子ジャーナル
  • 表面近傍における水分子の集団的な動き(並進と配向)の解析
    梅澤公二, 肥後順一
    アンサンブル, 15(1), 28-32, 2013年01月, 査読有り電子ジャーナル
  • Conformational ensembles of an intrinsically disordered protein pKID with and without a KIX domain in explicit solvent investigated by all-atom multicanonical molecular dynamics
    Koji Umezawa, Jinzen Ikebe, Mitsunori Takano, Haruki Nakamura, Junichi Higo
    BIOMOLECULES, 2(1), 104-121, 2012年02月22日, 査読有り電子ジャーナル
  • Theory for trivial trajectory parallelization of multicanonical molecular dynamics and application to a polypeptide in water
    Jinzen Ikebe, Koji Umezawa, Narutoshi Kamiya, Takanori Sugihara, Yasushige Yonezawa, Yu Takano, Haruki Nakamura, Junichi Higo
    JOURNAL OF COMPUTATIONAL CHEMISTRY, 32(7), 1286-1297, 2010年12月15日, 査読有り電子ジャーナル
  • Solvent flow patterns fluctuating largely around a protein and correlation with solvent density fluctuations: A molecular dynamics study
    Koji Umezawa, Ryota Morikawa, Haruki Nakamura, Junichi Higo
    The Journal of Chemical Physics, 132, 155103, 2010年04月16日, 査読有り電子ジャーナル
  • Conformational requirement on peptides to exert laminin's activities and search for protein segments with laminin's activities
    Koji Umezawa, Jinzen Ikebe, Motoyoshi Nomizu, Haruki Nakamura, Junichi Higo
    Biopolymers, 92(2), 124-131, 2009年01月29日, 査読有り電子ジャーナル
  • Solvent Site-Dipole Field Accompanying Protein-Ligand Approach Process
    Norikazu Takano, Koji Umezawa, et al.
    Chem-Bio Informatics Journal, 8(1), 14-24, 2008年04月29日, 査読有り電子ジャーナル
  • Structure dependency of a 24-residue peptide humanin on solvent and preferential solvation by trifluoroethanol studied by multicanonical sampling
    Ryosuke Yagisawa, Narutoshi Kamiya, Jinzen Ikebe, Koji Umezawa, Junichi Higo
    Chemical Physics Letters, 455(4-6), 293-296, 2008年04月10日, 査読有り電子ジャーナル
  • Collective solvent flows around a protein investigated by molecular dynamics simulation
    Koji Umezawa, Junichi Higo, Sakurako Shimotakahara, Heisaburo Shindo
    The Journal of Chemical Physics, 127(4), 045101, 2007年07月26日, 査読有り電子ジャーナル
  • Cyclic Peptide Analysis of the Biologically Active Loop Region in the Laminin α3 Chain LG4 Module Demonstrates the Importance of Peptide Conformation on Biological Activity
    Kozue Kato-Takagaki, Nobuharu Suzuki, Fumiharu Yokoyama, Shu Takaki, Koji Umezawa, Junichi Higo, Marumi Mochizuki, Yamato Kikkawa, Shinya Oishi, Atsushi Utani, Motoyoshi Nomizu
    Biochemistry, 46(7), 1952-1960, 2007年01月30日, 査読有り電子ジャーナル

書籍等出版物

  • Protein Conformational Dynamics: Advances in Experimental Medicine and Biology 805
    Junichi Higo, Koji Umezawa, 共著, Free-Energy Landscape of Intrinsically Disordered Proteins Investigated by All-Atom Multicanonical Molecular Dynamics
    Springer, 331-351 2013年12月16日
    ISBN:10.1007/978-3-319-02970-2_14

担当経験のある科目_授業

  • 化学系基礎実験
    信州大学
  • 生物物理化学
    信州大学
  • 生化学
    信州大学
  • 生命工学特論
    信州大学
  • 生命情報科学特論
    信州大学

共同研究・競争的資金等の研究課題

  • 癌の転移と浸潤を抑制するプロアントシアニジン類の合成と化学生物学的研究
    科学研究費補助金, 基盤(C)
    2018年04月01日 - 2020年03月31日
  • カテキン類の活性立体構造を解明するための分子計算
    公益財団法人信州農林科学振興会
    2016年 - 2016年
  • 分子シミュレーション
  • 計算構造生物学
  • 天然変性蛋白質

社会貢献活動

  • 分子もけいで学ぼう
    青少年のための科学の祭典2018 ブース出展, 信州大学伊那キャンパス, 2018年
  • カテキン多量体の立体構造および結合相手タンパク質の計算化学的研究
    第4回信大見本市 ブース出展, 長野県伊那市, 2017年

その他

  • 薬剤師
    2006年10月27日