博士（工学）, 東京大学

タンパク質工学，タンパク質デザイン，構造生物学，生物工学，合成生物学

2019年
先鋭領域融合研究群バイオメディカル研究所生体分子イノベーション部門 専任教員

2017年 - 2021年
Journal of Bioscience and Bioengineering, Editor

2016年 - 2019年
信州大学菌類・微生物ダイナミズム創発研究センター 超分子複合体部門 部門長（兼任）

2016年
信州大学学術研究院（繊維学系）　准教授

2014年 - 2016年
信州大学学術研究院（繊維学系）　助教

2013年 - 2018年
理化学研究所ライフサイエンス技術基盤研究センター　客員研究員兼務

2012年 - 2014年
信州大学繊維学部　助教

2007年 - 2012年
信州大学ファイバーナノテク国際若手研究者育成拠点　助教（テニュアトラック）

2006年 - 2007年
日本学術振興会　海外特別研究員

2004年 - 2006年
理化学研究所ゲノム科学総合研究センター　研究員

2001年 - 2006年
理化学研究所播磨研究所ストラクチュローム研究グループ兼務

2001年 - 2004年
理化学研究所ゲノム科学総合研究センター　リサーチアソシエイト

1998年 - 2001年
日本学術振興会　特別研究員(DC1)

2019年 - 2019年, 米国ワシントン大学タンパク質デザイン研究所 David Baker Lab, Visiting scholar

2006年 - 2007年, 米国プリンストン大学化学科 Michael H Hecht Lab （学振海外特別研究員）

2001年, 東京大学, 工学系研究科, 化学生命工学専攻

1998年, 東京大学, 工学系研究科, 化学生命工学専攻

1996年, 東京大学, 工学部, 化学生命工学科

2015年
酵素工学研究会, 酵素工学奨励賞
「配列パターンデザインによる新規人工設計タンパク質の半合理的創製と構造解析およびナノ構造構築への応用」

2013年
リバネス/メルクミリポア, 第13回リバネス研究費Direct Detect賞

2011年
Protein Data Bank 40th Anniversary Symposium, PDB40 Travel Award
Protein Data Bank 40th Anniversary Symposium

2011年
The Protein Society, Protein Science Young Investigator Travel Grant / The Protein Society Finn Wold Travel Award
IX European Symposium of The Protein Society

2001年
財団法人総合研究奨励会, 平成12年度石井学術奨励賞

1996年
化学工学会, 平成８年度化学工学会関東支部長賞（学生賞）

Crystal structure and activity of a de novo enzyme, ferric enterobactin esterase Syn-F4
Kodai Kurihara, Koji Umezawa, Ann E. Donnelly, Brendan Sperling, Guanyu Liao, Michael H. Hecht, and Ryoichi Arai
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 120(38), e2218281120, 2023年09月, 査読有り
最終著者, 責任著者

Enzymatic Fabrication of Multifunctional Amyloid-based Protein Assembly
Mitsuki Nakamura, Ryoichi Arai, Noriho Kamiya, Masafumi Sakono
Chemistry Letters, 52(7), 538-541, 2023年07月, 査読有り

One-pot synthesis of fibrillar-shaped functional nanomaterial using microbial transglutaminase
Sakono M, Nakamura M, Ohshima T, Miyakoshi A, Arai R, Minamihata K, Kamiya N.
J. Biosci. Bioeng., 135(6), 440-446, 2023年06月, 査読有り

Reversible Assembly of an Artificial Protein Nanocage Using Alkaline Earth Metal Ions
Ohara, Naoya; Kawakami, Norifumi; Arai, Ryoichi; Adachi, Naruhiko; Moriya, Toshio; Kawasaki, Masato; Miyamoto, Kenji;
JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY, 145(1), 216-223, 2023年01月, 査読有り

Multi-enzyme Machinery for Chitin Degradation in the Chitinolytic Bacterium Chitiniphilus shinanonensis SAY3T
Hiroaki Sato, Norie Sonoda, Moe Nakano, Yuka Matsuyama, Arisa Shizume, Ryoichi Arai, Masahiro Nogawa, Goro Taguchi & Makoto Shimosaka
CURRENT MICROBIOLOGY, 80, 360, 2023年, 査読有り

Production of pentaglycine-fused proteins using Escherichia coli expression system without in vitro peptidase treatment
Sakono, Masafumi; Oshima, Tatsuki; Iwakawa, Takako; Arai, Ryoichi;
PROTEIN EXPRESSION AND PURIFICATION, 194, 106068, 2022年06月, 査読有り

Self-Assembling Lectin Nano-Block Oligomers Enhance Binding Avidity to Glycans
Shin Irumagawa, Keiko Hiemori, Sayoko Saito, Hiroaki Tateno, Ryoichi Arai
INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES, 23(2), 676, 2022年01月, 査読有り
最終著者, 責任著者

Icosahedral 60-meric porous structure of designed supramolecular protein nanoparticle TIP60
Junya Obata, Norifumi Kawakami, Akihisa Tsutsumi, Erika Nasu, Kenji Miyamoto, Masahide Kikkawa, Ryoichi Arai
Chemical Communications, 57(79), 10226-10229, 2021年09月, 査読有り
最終著者, 責任著者

Rational thermostabilisation of four-helix bundle dimeric de novo proteins
Shin Irumagawa, Kaito Kobayashi, Yutaka Saito, Takeshi Miyata, Mitsuo Umetsu, Tomoshi Kameda & Ryoichi Arai
SCIENTIFIC REPORTS, 11, 7526, 2021年04月06日, 査読有り

Hyperstable De Novo Protein with a Dimeric Bisecting Topology
Kimura, N., Mochizuki, K., Umezawa K., Hecht, M.H., Arai, R.
ACS Synthetic Biology, 9(2), 254-259, 2020年, 査読有り

蛋白質ナノブロックによるレクチン超分子複合体の創出戦略
入間川伸，新井亮一
医学のあゆみ, 269(9), 690-696, 2019年, 査読有り

Lectin engineering: the possible and the actual
Hirabayashi, J., Arai, R.
Interface Focus, 9, 20180068, 2019年, 査読有り

人工タンパク質ナノブロック複合体の設計開発
小林 直也，川上 了史，新井 亮一
生化学会, 91(2), 255-259, 2019年, 査読有り

人工タンパク質ナノブロックによる多様な自己組織化ナノ構造複合体の創出
小林直也，新井亮一
生物物理, 58(6), 313-315, 2018年, 査読有り

Comparative analysis of plant isochorismate synthases reveals structural mechanisms underlying their distinct biochemical properties
2. Yokoo, S., Inoue, S., Suzuki, N., Amakawa, N., Matsui, H., Nakagami, H., Takahashi, A., Arai R. and Katou, S.
BIOSCIENCE REPORTS, 38, BSR20171457, 2018年, 査読有り

Hierarchical design of artificial proteins and complexes toward synthetic structural biology
Arai, R.
Biophysical Reviews, 10, 391-410, 2018年, 査読有り

Design of hollow protein nanoparticles with modifiable interior and exterior surfaces
Norifumi Kawakami, Hiroki Kondo, Yuki Matsuzawa, Kaoru Hayasaka, Erika Nasu, Kenji Sasahara, Ryoichi Arai, Kenji Miyamoto
Angewandte Chemie International Edition, 57, 12400-12404, 2018年, 査読有り

Self-assembling supramolecular nanostructures constructed from de novo extender protein nanobuilding blocks
Naoya Kobayashi, Kouichi Inano, Kenji Sasahara, Takaaki Sato, Keisuke Miyazawa, Takeshi Fukuma, Michael H Hecht, Chihong Song, Kazuyoshi Murata, and Ryoichi Arai
ACS Synthetic Biology, 7(5), 1381-1394, 2018年, 査読有り

Design and construction of self-assembling supramolecular protein complexes using artificial and fusion proteins as nanoscale building blocks
Kobayashi, N. and Arai, R.
Current Opinion in Biotechnology, 46, 57–65, 2017年, 査読有り

Characterization of silk gland ribosomes from a bivoltine caddisfly, Stenopsyche marmorata: translational suppression of a silk protein in cold conditions.
Takaomi Nomura, Miho Ito, Mai Kanamori, Yuta　Shigeno,　Toshio Uchiumi, Ryoichi Arai, Masuhiro Tsukada, Kimio Hirabayashi, Kousaku Ohkawa
Biochemical and biophysical research communications, 469, 210-215, 2016年, 査読有り

Flight density of the aquatic insect fauna over the water surface in the middle reaches of the Shinano River, Japan, mainly among caddisflies (Trichoptera)
Hirabayashi, K.*, Ikutama, E., Ohkawa, K., Arai, R., Nomura, T., Tsukada, M., and Abe, K.
Zoosymposia, 10, 203–213, 2016年

二量体形成新規人工タンパク質を用いたタンパク質ナノブロック開発による自己組織化ナノ構造複合体の創製
小林直也，新井亮一
分子研レターズ, 73, 30–31, 2016年

人工蛋白質で「かたち」をつくろう―ブロック遊びしようよ！
小林直也，新井亮一
生物工学会誌, 94, 270, 2016年

バイナリーパターン配列デザインによるデノボ蛋白質の創出と蛋白質ナノブロックによる超分子複合体の創生
小林直也，木村尚弥，新井亮一
生物工学会誌, 94, 485-488, 2016年

Expression, purification, crystallization and X-ray diffraction analysis of ChiL, a chitinase from Chitiniphilus shinanonensis
Miruku Ueda, Makoto Shimosaka and Ryoichi Arai
Acta Cryst. F, F71(12), 1516–1520, 2015年12月, 査読有り

Crystal structure of glycine oxidase from Geobacillus kaustophilus
Shiono, T., Nomura, T., Nishiya, Y., and Arai, R.
Photon Factory Activity Report 2014, 32(B), 204, 2015年

Crystal structure of Fab fragment of an anti-Osteocalcin C-Terminal peptide antibody KTM219
Komatsu, M., Dong, J., Ueda, H., and Arai, R.
Photon Factory Activity Report 2014, 32(B), 205, 2015年

Crystal structure of ChiL, a chitinase from Chitiniphilus shinanonensis
Ueda, M., Shimosaka, M., and Arai, R.
Photon Factory Activity Report 2014, 32(B), 206, 2015年

Molecular cloning, gene expression analysis, and recombinant protein expression of novel silk proteins from larvae of a retreat-maker caddisfly, Stenopsyche marmorata
Xue Bai, Mayo Sakaguchi, Yuko Yamaguchi, Shiori Ishihara, Masuhiro Tsukada, Kimio Hirabayashi, Kousaku Ohkawa, Takaomi Nomura, Ryoichi Arai
Biochem. Biophys. Res. Commun., 464(3), 814–819, 2015年, 査読有り

Self-Assembling Nano-Architectures Created from a Protein Nano-Building Block Using an Intermolecularly Folded Dimeric de Novo Protein
Naoya Kobayashi, Keiichi Yanase, Takaaki Sato, Satoru Unzai, Michael H. Hecht, Ryoichi Arai
J. Am. Chem. Soc., 137(35), 11285–11293, 2015年, 査読有り

Intermolecular interactions and molecular dynamics in bovine serum albumin solutions studied by small angle X-ray scattering and dielectric relaxation spectroscopy.
Yanase, K., Arai R., and Sato, T.
J. Mol. Liq., 200(A), 59-66, 2014年, 査読有り

Functional characterization of FABP3, 5 and 7 gene variants identified in schizophrenia and autism spectrum disorder and mouse behavioral studies.
Shimamoto C, Ohnishi T, Maekawa M, Watanabe A, Ohba H, Arai R, Iwayama Y,　Hisano Y, Toyota T, Toyoshima M, Suzuki K, Shirayama Y, Nakamura K, Mori N, Owada, Y, Kobayashi T, and Yoshikawa T
Hum. Mol. Genet., 23, 6495-6511, 2014年, 査読有り

Crystal structure of glycine oxidase from Bacillus thuringiensis
Ohishi, S., Shiono, T., Nishiya, Y., Nomura, T., and Arai, R.
Photon Factory Activity Report 2013, 31(B), 274, 2014年

Chain conformational study on underwater silk protein from caddisfly, Stenopsyche marmorata: Implication of a fiber-forming mechanism
Ohkawa, K., Hachisu, M., Nomura, T., Arai, R., Hirabayashi, K., Tsukada, M., and Abe, K
Adv. Mater. Res., 796, 41706, 2013年

バイナリーパターンデザインによるデノボタンパク質WA20のドメインスワップ二量体構造
小林直也，*新井亮一
酵素工学研究会誌, 69, 19-25, 2013年

Long-range periodic sequence of Stenopsyche marmorata cement/silk protein: Purification and biochemical characterization
Ohkawa, K., Miura, Y., Nomura, T., Arai, R., Abe, K., Tsukada M. and Hirabayashi, K.
Biofouling, 29(4), 357-367, 2013年, 査読有り

Isolation of silk proteins from a caddisfly larva, Stenopsyche marmorata.
Ohkawa, K., Miura, Y., Nomura, T., Arai, R., Abe, K., Tsukada M. and Hirabayashi, K.
J. Fiber Bioeng. Informatics, 5, 125-137, 2012年

Domain-Swapped Dimeric Structure of a Stable and Functional De Novo 4-Helix Bundle Protein, WA20
Arai, R., Kobayashi, N., Kimura, A., Sato, T., Matsuo, K., Wang, A.F., Platt, J.M., Bradley, L.H., Hecht, M.H.
J. Phys. Chem. B, 116(23), 6789-6797, 2012年, 査読有り

Solution structure of IseA, an inhibitor protein of DL-endopeptidases from Bacillus subtilis, reveals a novel fold with a characteristic inhibitory loop
Arai, R., Fukui, S., Kobayashi, N. and Sekiguchi, J.
J. Biol. Chem., 287(53), 44736-44748, 2012年, 査読有り

Crystal structure of a dimeric de novo 4-helix bundle protein, WA20
Arai, R., Kobayashi, N., Kimura, A., Sato, T., Wang, A.F., Platt, J.M., Bradley, L.H. and Hecht, M.H.
Photon Factory Activity Report 2010, 28, B256, 2011年

Crystal structure of a menaquinone biosynthetic enzyme, TthMqnD, complexed with its product, 1,4-dihydroxy-6-naphthoate
Matsuo, K., Dairi, T., Seto, H. and Arai, R.
Photon Factory Activity Report 2010, 28, B298, 2011年

Dissecting cell signaling pathways with genetically encoded 3-iodo-L-tyrosine
Hayashi A, Hino N, Kobayashi T, Arai R, Shirouzu M, Yokoyama S, Sakamoto K.
ChemBioChem, 12, 387-389, 2011年, 査読有り

Polymorphism screening of brain-expressed FABP7, 5 and 3 genes and association studies in autism and schizophrenia in Japanese subjects
Maekawa, M.,Iwayama, Y., Arai, R., Nakamura, K., Ohnishi, T., Toyota, T., Tsujii, M., Okazaki, Y., Osumi, N., Owada, Y., Mori, N., and Yoshikawa, T.
J. Hum. Genet., 55, 127-130, 2010年, 査読有り

Crystal structure of MqnD (TTHA1568), a menaquinone biosynthetic enzyme from Thermus thermophilus HB8
Arai, R., Murayama, K., Uchikubo-Kamo, T., Nishimoto, M., Toyama, M., Kuramitsu, S., Terada, T., Shirouzu, M. and Yokoyama, S.
J. Struct. Biol, 168, 575-581, 2009年, 査読有り

Structure of archaeal glyoxylate reductase from Pyrococcus horikoshii OT3 complexed with nicotinamide adenine dinucleotide phosphate
Yoshikawa, S.,* Arai, R.,* Kinoshita, Y., Uchikubo-Kamo, T., Wakamatsu, T., Akasaka, R., Masui, R., Terada, T., Kuramitsu, S., Shirouzu, M. and Yokoyama, S. (*The authors contributed equally to the work.)
Acta Crystallogr. D, 63, 357-365, 2007年, 査読有り

Crystal structure of human myo-inositol monophosphatase 2, the product of the putative susceptibility gene for bipolar disorder, schizophrenia, and febrile seizures
Arai, R.,* Ito, K.,* Ohnishi, T., Ohba, H., Akasaka, R., Bessho, Y., Hanawa-Suetsugu, K., Yoshikawa, T., Shirouzu, M. and Yokoyama, S.
Proteins, 67, 732-742, 2007年, 査読有り

Fabp7 Maps to a Quantitative Trait Locus for a Schizophrenia Endophenotype
Watanabe, A., Toyota, T., Owada, Y., Hayashi, T., Iwayama, Y., Matsumata, M., Ishitsuka, Y., Nakaya, A., Maekawa, M., Ohnishi, T., Arai, R., Sakurai, K., Yamada, K., Kondo, H., Hashimoto, K., Osumi, N. and Yoshikawa T.
PLoS Biol., 5, E297, 2007年, 査読有り

Crystal structure of the probable haloacid dehalogenase PH0459 from Pyrococcus horikoshii OT3
Arai, R., Kukimoto-Niino, M., Kuroishi, C., Bessho, Y., Shirouzu, M. and Yokoyama, S.
Protein Sci., 15, 373-377, 2006年, 査読有り

Structure of human ubiquitin-conjugating enzyme E2 G2 (UBE2G2/UBC7)
Arai, R.,* Yoshikawa, S.,* Murayama, K., Imai, Y., Takahashi, R., Shirouzu, M. and Yokoyama, S.
Acta Crystallogr. F, 62, 330-334, 2006年, 査読有り

Crystal structure of the conserved protein TTHA0727 from Thermus thermophilus HB8 at 1.9 A resolution: A CMD family member distinct from carboxymuconolactone decarboxylase (CMD) and AhpD
Ito, K.,* Arai, R.,* Fusatomi, E., Kamo-Uchikubo, T., Kawaguchi, S., Akasaka, R., Terada, T., Kuramitsu, S., Shirouzu, M. and Yokoyama, S.
Protein Sci., 15, 1187-1192, 2006年, 査読有り

Conserved protein TTHA1554 from Thermus thermophilus HB8 binds to glutamine synthetase and cystathionine beta-lyase
Arai, R.,* Nishimoto, M.,* Toyama, M., Terada, T., Kuramitsu, S., Shirouzu, M. and Yokoyama, S. Conserved protein TTHA1554 from Thermus thermophilus HB8 binds to glutamine synthetase and cystathionine beta-lyase
Biochim. Biophys. Acta, 1750, 40-47, 2005年, 査読有り

Crystal structure of an enhancerof rudimentary homolog (ERH) at 2.1 Angstroms resolution
Arai, R., Kukimoto-Niino, M., Uda-Tochio, H., Morita, S., Uchikubo-Kamo, T., Akasaka, R., Etou, Y., Hayashizaki, Y., Kigawa, T., Terada, T., Shirouzu, M. and Yokoyama, S.
Protein Sci., 14, 1888-1893, 2005年, 査読有り

Conformations of variably linked chimeric proteins evaluated by synchrotron X-ray small-angle scattering
Arai, R., Wriggers, W., Nishikawa, Y., Nagamune, T. and Fujisawa, T.
Proteins, 57, 829-838, 2004年, 査読有り

Phosphorylation analysis of 90 kDa heat shock protein within the cytosolic arylhydrocarbon receptor complex
Ogiso, H., Kagi, N., Matsumoto, E., Nishimoto, M., Arai, R., Shirouzu, M., Mimura, J., Fujii-Kuriyama, Y. and Yokoyama, S.
Biochemistry, 43, 15510-15519, 2004年, 査読有り

Establishment of stable hFis1 knockdown cells with an siRNA expression vector
Arai, R.,* Ito,K.,* Wakiyama, M., Matsumoto, E., Sakamoto, A., Etou, Y., Otsuki, M., Inoue, M., Hayashizaki, Y., Miyagishi, M., Taira, K., Shirouzu, M. and Yokoyama, S.
J. Biochem., 136, 421-425, 2004年, 査読有り

An optimized homogeneous noncompetitive immunoassay based on the antigen-driven enzymatic complementation
Ueda, H., Yokozeki, T., Arai, R., Tsumoto, K., Kumagai, I. and Nagamune, T.
J. Immunol. Methods, 279, 209-218, 2003年, 査読有り

Detection of protein-protein interaction by bioluminescence resonance energy transfer from firefly luciferase to red fluorescent protein
Arai, R., Nakagawa, H., Kitayama, A., Ueda, H. and Nagamune, T
J. Biosci. Bioeng., 94, 362-364, 2002年, 査読有り

A homogeneous and noncompetitive immunoassay based on the enhanced fluorescence resonance energy transfer by leucine zipper interaction
Ohiro, Y., Arai, R., Ueda, H. and Nagamune, T.
Anal. Chem., 74, 5786-5792, 2002年, 査読有り

A homogeneous noncompetitive immunoassay for the detection of small haptens
Yokozeki, T., Ueda, H., Arai, R., Mahoney, W. and Nagamune, T.
Anal. Chem., 74, 2500-2504, 2002年, 査読有り

Design of an artificial light-harvesting unit by protein engineering: Cytochrome b(562)-green fluorescent protein chimera
Takeda, S., Kamiya, N., Arai, R. and Nagamune, T.
Biochem. Biophys. Res. Commun., 289, 299-304, 2001年, 査読有り

Construction of green fluorescent protein reporter genes for genotoxicity test (SOS/umu-Test) and improvement of mutagen-sensitivity
Arai, R., Makita, Y., Oda, Y. and Nagamune, T.
J. Biosci. Bioeng, 92, 301-304, 2001年, 査読有り

Design of the linkers which effectively separate domains of a bifunctional fusion protein
Arai, R., Ueda, H., Kitayama, A., Kamiya, N. and Nagamune, T.
Protein Eng., 14, 529-532, 2001年, 査読有り

Demonstration of a homogeneous noncompetitive immunoassay based on bioluminescence resonance energy transfer
Arai, R., Nakagawa, H., Tsumoto, K., Mahoney, W., Kumagai, I., Ueda, H. and Nagamune, T.
Anal. Biochem., 289, 77-81, 2001年, 査読有り

Fluorolabeling of antibody variable domains with green fluorescent protein variants: application to an energy transfer-based homogeneous immunoassay
Arai, R., Ueda, H., Tsumoto, K., Mahoney, W.C., Kumagai, I. and Nagamune, T.
Protein Eng., 13, 369-376, 2000年, 査読有り

Construction of chimeric proteins between protein G and fluorescence-enhanced green fluorescent protein, and their application to immunoassays
Arai, R., Ueda, H. and Nagamune, T.
J. Ferment. Bioeng., 86, 440-445, 1998年, 査読有り

糖タンパク質の糖鎖修飾部位の網羅的同定方法
新井亮一　（トピックス解説）
ぶんせき, (11), 686, 2003年, 査読有り

Protein Cages, Methods in Molecular Biology 2671
Naoya Kobayashi and Ryoichi Arai, 分担執筆, Protein Cages and Nanostructures Constructed from Protein Nanobuilding Blocks
Humana Press (Springer Nature), 79-94 2023年06月

クライオ電子顕微鏡ハンドブック
新井亮一，川上了史，小幡隼也，包明久，那須英里圭，宮本憲二，吉川雅英, 分担執筆, 人工設計タンパク質ナノ粒子TIP60の立体構造解析
エヌ・ティー・エス, 165–174 2023年

Methods in Enzymology 647
Ryoichi Arai, 分担執筆, Linkers in Biomacromolecules Chapter 8 "Design of helical linkers for fusion proteins and protein-based nanostructures"
Elsevier, 209-230 2021年, 査読有り
ISBN:10.1016/bs.mie.2020.10.003

Biotechnology of Silk: Biologically inspired systems Volume 5
Ohkawa, K., Nomura, T., Arai, R., Hirabayashi, K., Tsukada, M., and Abe , K., 分担執筆, Characterization of underwater silk proteins from caddisfly larva, Stenopsyche marmorata
Springer, New York, Ch. 6, pp. 107-122 2013年

蛋白質核酸酵素（増刊号）「ゲノムネットワーク」 49
新井亮一，白水美香子，横山茂之，廣田 洋, 分担執筆, 蛋白質-蛋白質相互作用「Tagged-MS法」
共立出版, 2763-2767 2004年

実験医学別冊「GFPとバイオイメージング
新井亮一，上田 宏，長棟輝行, 分担執筆, GFPの検出およびイメージング技術「分子間相互作用解析実験」
羊土社, 207-214 2000年

Crystal structures of MqnD, a menaquinone biosynthetic enzyme, complexed with the product, 1,4-dihydroxy-6-naphthoate, and its analogs
Arai, R., Matsuo, K. and Dairi, T.
4th International Symposium on Diffraction Structural Biology 2013 (ISDSB2013), 2013年

A De Novo Heme Protein, Dnhps1, Created from a 5-Amino Acid Alphabet
Fukuda, S., Kurasawa, S., and Arai, R.
27th Annual Symposium of The Protein Society, 2013年

Solution structure of IseA, an inhibitor protein of DL-endopeptidases from Bacillus subtilis, reveals a novel fold with a characteristic inhibitory loop
Arai, R., Fukui, S., Kobayashi, N. and Sekiguchi, J.
International Conference on Structural Genomics 2013 (ICSG2013), 2013年

Structural and functional analyses of binary pattern designed de novo proteins
Arai, R. Kobayashi, N., Fukuda, S., Kurasawa, S. and Hecht, M. H.
Enzyme Engineering XXII, 2013年

Characterization and nanofiber fabrication of underwater silk protein from Stenopsyche marmorata
Kousaku Ohkawa, Yumi Miura, Takaomi Nomura, Ryoichi Arai, Kimio Hirabayashi, Masuhiro Tsukada, and Koji Abe
American Chemical Society, National Meething, 2013 Spring, 2013年

Biochemical natures of underwater silk proteins from caddisfly, Stenopsyche marmorata
Kousaku Ohkawa, Masakazu Hachisu, Takaomi Nomura, Ryoichi Arai, Masuhiro Tsukada and Kimio Hirabayashi
The International Textile Conference 2013, 2013年

Construction and characterization of tandem WA20 domain-swapped de novo proteins with various linkers.
Naoya Kobayashi, N., Michael H. Hecht, and Ryoichi Arai
27th Annual Symposium of The Protein Society., 2013年

Molecular cloning of novel silk proteins from larvae of caddisfly, Stenopsyche marmorata
X.Bai, K.Ohkawa, T.Nomura, S.Ishihara, Y.Yamaguchi, M.Tsukada, K.Abe, K.Hirabayashi, R. Arai
Young Researcher Symposium 2013, 2013年

Molecular cloning of novel silk proteins from larvae of caddisfly, Stenopsyche marmorata
K. Ohkawa, M. Hachisu, T.Nomura, R.Arai, K. Hirabayashi, M. Tsukada and K. Abe
8th Chaina International Silk Conference 2013, 2013年

De novo proteins and interaction analysis using pattern-designed peptide libraries
Arai, R., Kobayashi, N., Kimura, A., Teranishi, H., Sato, T., Bradley, L. H., Nishimura, Y., and Hecht, M. H.
Gordon Research Conference, Intrinsically Disordered Proteins, 2012年

Domain-Swapped Dimeric Structure of a Stable and Functional De Novo Four-Helix Bundle Protein WA20, and its Potential Application
Arai, R., Kobayashi, N., Kimura, A., Sato, T., and Hecht, M. H.
18th Symposium of Young Asian Biochemical Engineers' Community (YABEC2012), 2012年

Underwater silk fibers–Biochemical natures for novel textile technology
Kousaku Ohkawa, Yumi Miura, Takaomi Nomura, Ryoichi Arai, Koji Abe, Masuhiro Tsukada and Kimio Hirabayashi
9th Asia-Pacific Marine Biotechnogy Conference, 2012年

Isolation of silk proteins from a caddisfly larva, Stenopsyche marmorata
Kousaku Ohkawa, Yumi Miura, Takaomi Nomura, Ryoichi Arai, Koji Abe, Masuhiro Tsukada and Kimio Hirabayashi
Textile Bioengneering Informatics Symposium 2012, 2012年

Repetitive Sequential Motifs of Underwater Silk Protein from Caddisfly, Stenopsyche marmorata, 
Kousaku OHKAWA, Yumi MIURA, Takaomi NOMURA, Ryoichi ARAI, Kimio HIRABAYASHI, Masuhiro TSUKADA, and Koji ABE
American Chemical Society, Annual Meeting Spring 2012, 2012年

Function and Three Dimensional Structure of an Autolysin Inhibitor IseA from Bacillus subtilis
Junichi Sekiguchi and Ryoichi Arai
American Society for Microbiology, General Meeting (asm2012), 2012年

Flight density of aquatic insects fauna over river water surface in the middle reaches of the Shinano River, Japan, with emphasis on Trichoptera.
Hirabayashi K., Ohkawa K., Arai R., Nomura T., Tsukada M. and Abe K.
14th International symposium on Trichoptera, 2012年

Crystal structure of a dimeric de novo 4-helix bundle protein WA20
Arai, R., Kimura, A., Kobayashi, N., Sato, T., Wang, A. F., Platt, J., Bradley, L. H. and Hecht, M. H.
IX European Symposium of The Protein Society 13013, p.87, 2011年

Domain-swapped dimeric structure of a de novo 4-helix bundle protein, WA20
Arai, R., Kobayashi, N., Kimura, A., Sato, T., Wang, A. F., Platt, J., Bradley, L. H. and Hecht, M. H.
PDB40 Symposium (A Special Symposium Celebrating the 40th Anniversary of the Protein Data Bank), 2011年

Domain-swapped dimeric structure of a stable and functional de novo 4-helix bundle protein, WA20
Kobayashi, N., Kimura, A., Sato, T., Matsuo T., Wang, A. F., Platt, J., Bradley, L. H. Hecht, M. H. and Arai, R.,
6th International Conference on Advanced Fiber/Textile Materials 2011, 2011年

Crystal structure of MqnD, a menaquinone biosynthetic enzyme from Thermus thermophilus HB8
Arai, R., Murayama, K., Uchikubo-kamo, T., Nishimoto, M., Toyama, M., Kuramitsu, S., Terada, T., Shirouzu, M. and Yokoyama, S.
Gordon Research Conference, Biopolymers 0, 2010年

Crystal structure of MqnD (TTHA1568), a menaquinone biosynthetic enzyme from Thermus thermophilus HB8
R. Arai, K. Murayama, T. Uchikubo-Kamo, M. Nishimoto, M. Toyama, S. Kuramitsu, T. Terada, M. Shirouzu, S. Yokoyama
21st IUBMB and 12th FAOBMB International Congress of Biochemistry and Molecular Biology, 2009年

A four-helix bundle de novo heme protein by phage display screening
R. Arai, M. H. Hecht
7th East Asian Symposium on Polymers for Advanced Technologies (EASPAT 2009), 2009年

Protein Composition in Silk Grand of Caddisfly, Stenopsyche Marmorata, Larva.
K. Ohkawa, T. Nomura, R.Arai, K. Abe, M. Tsukada, K. Hirabayashi
14th International Symposium on River and Lake Environments, 2009年

Design and construction of functional artificial proteins: Phage display screening of four-helix bundle de novo proteins
R. Arai, M.H. Hecht
4th International Conference on Advanced Fiber/Textile Materials 2007 in Ueda (ICAFTM2007), 2007年

情報科学・統計学演習(分担）
信州大学

情報科学・統計学演習(分担）
信州大学

情報科学・統計学演習(分担）
信州大学

情報科学・統計学演習(分担）
信州大学

情報科学・統計学演習(分担）
信州大学

情報科学・統計学演習(分担）
信州大学

情報科学・統計学演習(分担）
信州大学

情報科学・統計学演習(分担）
信州大学

情報科学・統計学演習(分担）
信州大学

分子生物学Ⅱ（分担）
信州大学

分子生物工学実験（分担）
信州大学

分子生物工学実験（分担）
信州大学

生化学Ⅱ
信州大学

生化学Ⅱ
信州大学

生化学Ⅱ
信州大学

作文・プレゼンテーション演習
信州大学

作文・プレゼンテーション演習
信州大学

フィールド科学実習（分担）
信州大学

資源生物利用学実験（分担）
信州大学

フィールド科学実習（分担）
信州大学

資源生物利用学実験（分担）
信州大学

生化学Ⅱ
信州大学

作文・プレゼンテーション演習
信州大学

フィールド科学実習（分担）
信州大学

資源生物利用学実験（分担）
信州大学

生化学Ⅱ
信州大学

作文・プレゼンテーション演習
信州大学

フィールド科学実習（分担）
信州大学

資源生物利用学実験（分担）
信州大学

化学基礎実験I(分担）
信州大学

新入生ゼミナール(分担）
信州大学

新入生ゼミナール(分担）
信州大学

化学基礎実験I(分担）
信州大学

新入生ゼミナール(分担）
信州大学

化学基礎実験I(分担）
信州大学

新入生ゼミナール(分担）
信州大学

化学基礎実験I(分担）
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新入生ゼミナール(分担）
信州大学

化学基礎実験I(分担）
信州大学

新入生ゼミナール(分担）
信州大学

化学基礎実験I(分担）
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新入生ゼミナール(分担）
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化学基礎実験I(分担）
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新入生ゼミナール(分担）
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化学基礎実験I(分担）
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新入生ゼミナール(分担）
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化学基礎実験I(分担）
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新入生ゼミナール(分担）
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生化学Ⅱ
信州大学

生化学Ⅱ
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生化学Ⅱ
信州大学

生化学Ⅱ
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生化学Ⅱ
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生化学Ⅱ
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蛋白質工学（分担）
信州大学

生化学Ⅱ
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日本蛋白質科学会

日本生物工学会

日本分子生物学会

酵素工学研究会

日本化学会生体機能関連化学部会

「細胞を創る」研究会

機能性タンパク質ナノブロック複合体創製の基盤的プロセス技術開発と応用展開
科学研究費補助金, 基盤研究(B)
2019年 - 2021年

蛋白質ナノブロック複合体の合理的超四次構造形成による機能性超分子結晶ナノ材料開発
科学研究費補助金, 国際共同研究加速基金(国際共同研究強化)
2018年 - 2020年

サーマルプログラミングによる蛋白質ナノブロックの逐次的自己組織化基盤技術の開発
科学研究費補助金, 基盤研究(C)
2016年 - 2019年

人工蛋白質ナノブロック自己組織化超分子複合体の構造機能解析と動的秩序系設計構築
科学研究費補助金, 新学術領域研究（生命分子システムにおける動的秩序形成と高次機能発現・公募研究）
2016年 - 2017年

水生昆虫シルクナノ繊維と3次元織布技術を用いる幹細胞培養足場材料開発
科学研究費補助金, 基盤研究（B）
2014年 - 2017年

植物のフラボノイドＣ配糖化酵素の反応機構の解明
科学研究費補助金, 基盤研究（Ｃ）
2014年 - 2016年

限定アミノ酸セットによる原始的人工ヘム蛋白質の創製及び分子進化工学，第13回リバネス研究費Direct Detect賞
2013年

ピロリ菌型メナキノン生合成経路酵素群の立体構造解析及び反応機構解明
科学研究費補助金, 若手研究（B）
2012年 - 2015年

網羅的ペプチド相互作用実験データを用いた天然変性蛋白質の特性解析と親和性デザイン
科学研究費補助金, 新学術領域研究（天然変性タンパク質の分子認識機構と機能発現・公募研究）
2012年 - 2013年

細菌細胞表層制御による細胞増殖，形態，機能維持メカニズムの解明
科学研究費補助金, 基盤研究（Ａ）
2010年 - 2012年

アレルギー性疾患予防のためのトビケラ目大量飛来時期高精度予測手法の開発
科学研究費補助金, 基盤研究（Ｃ）
2010年 - 2012年

水生昆虫バイオシルクの特性解析、高機能化、医工学分野への応用
科学研究費補助金, 基盤研究（Ｃ）
2010年 - 2012年

パターンデザインペプチドライブラリーを用いた天然変性タンパク質の特性解析
科学研究費補助金, 新学術領域研究（天然変性タンパク質の分子認識機構と機能発現・公募研究）
2010年 - 2011年

新規メナキノン生合成経路酵素の構造機能解析及び阻害剤探索, ホクト生物科学振興財団研究奨励金給付事業
ホクト生物科学振興財団
2010年

信州産ヒゲナガカワトビケラの絹糸に学ぶ新繊維材料の創出に向けて, 平成20年度信州大学若手研究者萌芽研究支援事業
2008年 - 2008年

タンパク質ナノブロック複合体の設計開発

人工タンパク質の設計開発

改変・融合タンパク質の構築と応用

タンパク質のX線結晶構造解析

2009年, 2, 2

2008年, 1, 1

2017年, 2, 2, 3

2018年, 2, 2, 5, 3

2010年, 2, 2, 2, 1

2011年, 2, 1, 2, 4, 1

2012年, 2, 2, 4, 1, 3, 1

2020年, 3, 3, 2, 1, 1

2019年, 2, 2, 3, 2, 1

2021年, 3, 2, 1

2013年, 3, 3, 2, 1, 1, 1, 1

2014年, 2, 2, 4, 1, 1

2015年, 2, 2, 4, 3, 1

2016年, 2, 2, 2, 1, 1, 1

2011年, 1, 1, B4

2013年, 1, 1, M2

2012年, 1, 1, M1

2012年, 委員

2013年, 委員