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梅澤公二  ウメザワ コウジ

教員組織学術研究院(農学系)電話番号
教育組織先鋭領域融合研究群 バイオメディカル研究所FAX番号
職名助教メールアドレス
住所〒399-4598 長野県上伊那郡南箕輪村8304ホームページURL

プロフィール

兼担研究科・学部
大学院総合理工学研究科 生命医工学専攻 生命工学分野
研究分野
生物物理学
現在の研究課題
分子シミュレーション

計算構造生物学

天然変性蛋白質

学歴
出身大学院
2011 , 大阪大学 , 生命機能研究科 , 生命機能専攻
2008 , 東京薬科大学 , 生命科学研究科 , 生命科学専攻

出身学校・専攻等(大学院を除く)
2006 , 東京薬科大学 , 薬学部 , 製薬学科

取得学位
博士(理学) , 大阪大学
修士(生命科学) , 東京薬科大学

免許・資格等
20061027 , 薬剤師
研究職歴等
研究職歴
2016- , 信州大学総合理工学研究科 生命医工学専攻・助教(特定雇用)
2013-2016 , 早稲田大学理工学術院・日本学術振興会 特別研究員PD
2011-2013 , 早稲田大学理工学術院先進理工学・次席研究員

研究活動業績

研究業績(著書・
発表論文等)
著書
Free-Energy Landscape of Intrinsically Disordered Proteins Investigated by All-Atom Multicanonical Molecular Dynamics
Springer , Protein Conformational Dynamics: Advances in Experimental Medicine and Biology , 805:331-351 2013(Dec. 16)
Author:Junichi Higo, Koji Umezawa


論文
Synthesis of epigallocatechin trimer, (epigallocatechin)2-epicatechin, and (epigallocatechin)2-catechin via a Lewis acid mediated one-pot condensation and their antitumor activities in prostate cancer cells.
Tetrahedron,74(27):3534-3542 2018(Jul. 05)
Author:Ichikawa M, Yamamoto S, Ishihara C, Nonobe S, Hattori Y, Umezawa K, Fujii H, Makabe H


Structural and dynamical characteristics of tropomyosin epitopes as the major allergens in shrimp.
Biochemical and Biophysical Research Communications,498(1) 2018(Mar. 25)
Author:Ozawa H, Umezawa K, Takano M, Ishizaki S, Watabe S, Ochiai Y


Epicatechin oligomers longer than trimers have anti-cancer activities, but not the catechin counterparts
Scientific Reports,7(1):7791 2017(Aug. 10)
Author:Takanashi K, Suda M, Matsumoto K, Ishihara C, Toda K, Kawaguchi K, Senga S, Kobayashi N, Ichikawa M, Katoh M, Hattori Y, Kawahara S, Umezawa K, Fujii H, and Makabe H


Over-Destabilization of Protein-Protein Interaction in Generalized Born Model and Utility of Energy Density Integration Cutoff
Journal of Physical Chemistry B,121:4669-4677 2017(Apr. 20)
Author:Mizuhara Y, Parkin D, Umezawa K, Ohnuki J, Takano M


分子動力学シミュレーションで探る天然変性タンパク質の準安定複合体構造と結合解離調節機構
信州大学農学部紀要,53:34-43 2017(Mar. 21)
Author:梅澤公二


Intrinsic disorder accelerates dissociation rather than association
Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics,-(-):- 2016(May 18)
Author:Koji Umezawa, Jun Ohnuki, Junichi Higo, Mitsunori Takano


Enhanced sampling simulations to construct free-energy landscape of protein–partner substrate interaction
Biophysical Reviews,8(1):45-62 2016(Jan. 11)
Author:Jinzen Ikebe, Koji Umezawa, Junichi Higo


全原子コンピュータシミュレーションで解き明かす,天然変性蛋白 質の分子認識機構
生物物理,54(2):096-099 2014(Apr.)
Author:肥後順一, 梅澤公二


virtual-system coupled multicanonical molecular dynamics simulation: Principles and applications to free-energy landscape of protein–protein interaction with an all-atom model in explicit solvent
The Journal of Chemical Physics,138:184106 2013(May 10)
Author:Junichi Higo, Koji Umezawa, Haruki Nakamura


表面近傍における水分子の集団的な動き(並進と配向)の解析
アンサンブル,15(1):28-32 2013(Jan.)
Author:梅澤公二, 肥後順一


Conformational ensembles of an intrinsically disordered protein pKID with and without a KIX domain in explicit solvent investigated by all-atom multicanonical molecular dynamics
Biomolecules,2(1):104-121 2012(Feb. 22)
Author:Koji Umezawa, Jinzen Ikebe, Mitsunori Takano, Haruki Nakamura, Junichi Higo


Theory for trivial trajectory parallelization of multicanonical molecular dynamics and application to a polypeptide in water
Journal of Computational Chemistry,32(7):1286-1297 2010(Dec. 15)
Author:Jinzen Ikebe, Koji Umezawa, Narutoshi Kamiya, Takanori Sugihara, Yasushige Yonezawa, Yu Takano, Haruki Nakamura, Junichi Higo


Solvent flow patterns fluctuating largely around a protein and correlation with solvent density fluctuations: A molecular dynamics study
The Journal of Chemical Physics,132:155103 2010(Apr. 16)
Author:Koji Umezawa, Ryota Morikawa, Haruki Nakamura, Junichi Higo


Conformational requirement on peptides to exert laminin's activities and search for protein segments with laminin's activities
Biopolymers,92(2):124-131 2009(Jan. 29)
Author:Koji Umezawa, Jinzen Ikebe, Motoyoshi Nomizu, Haruki Nakamura, Junichi Higo


Solvent Site-Dipole Field Accompanying Protein-Ligand Approach Process
Chem-Bio Informatics Journal,8(1):14-24 2008(Apr. 29)
Author:Norikazu Takano, Koji Umezawa, et al.


Structure dependency of a 24-residue peptide humanin on solvent and preferential solvation by trifluoroethanol studied by multicanonical sampling
Chemical Physics Letters,455(4-6):293-296 2008(Apr. 10)
Author:Ryosuke Yagisawa, Narutoshi Kamiya, Jinzen Ikebe, Koji Umezawa, Junichi Higo


Collective solvent flows around a protein investigated by molecular dynamics simulation
The Journal of Chemical Physics,127(4):045101 2007(Jul. 26)
Author:Koji Umezawa, Junichi Higo, Sakurako Shimotakahara, Heisaburo Shindo


Cyclic Peptide Analysis of the Biologically Active Loop Region in the Laminin α3 Chain LG4 Module Demonstrates the Importance of Peptide Conformation on Biological Activity
Biochemistry,46(7):1952-1960 2007(Jan. 30)
Author:Kozue Kato-Takagaki, Nobuharu Suzuki, Fumiharu Yokoyama, Shu Takaki, Koji Umezawa, Junichi Higo, Marumi Mochizuki, Yamato Kikkawa, Shinya Oishi, Atsushi Utani, Motoyoshi Nomizu

研究費
科学研究費補助金(研究分担者)
2018 - 2020 , 癌の転移と浸潤を抑制するプロアントシアニジン類の合成と化学生物学的研究 , 基盤(C)

その他
2016 - 2016 , カテキン類の活性立体構造を解明するための分子計算

教育活動実績

授業等
2018 , 前期 , 生命情報科学特論
2018 , 前期 , 生命工学特論

社会活動実績

社会活動等
その他社会活動
カテキン多量体の立体構造および結合相手タンパク質の計算化学的研究 , 第4回信大見本市 ブース出展
分子もけいで学ぼう , 青少年のための科学の祭典2018 ブース出展