山本 博規 (ヤマモト ヒロキ)
学術研究院（繊維学系）
繊維学部 応用生物科学科
教授
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論文
- Visualization of wall teichoic acid decoration in Bacillus subtilis.
Yutaka Koyano, Kiyoshirou Okajima, Mako Mihara, Hiroki Yamamoto
Journal of Bacteriology, 205(4), e0006623, 2023年, 査読有り, 招待無し
最終著者, 責任著者
- Digestion of peptidoglycan near the cross-link is necessary for the growth of Bacillus subtilis
Hashimoto, M., Matsushima, H., Suparthana I. P., Ogasawara, H., Yamamoto, H., Teng, C., Sekiguchi, J.
Microbiology, 164, 299～307, 2018年, 査読有り - The transmembrane segment of TagH is required for wall teichoic acid transport under heat stress in Bacillus subtilis
Yamada, T., Miyashita, M., Kasahara, J., Tanaka, T., Hashimoto, M., Yamamoto, H.
Microbiology, 164, 935-945, 2018年, 査読有り - Teichoic acid polymers affect expression and localization of DL-endopeptidase LytE required for lateral cell wall hydrolysis in Bacillus subtilis.
Kasahara, J., Y. Kiriyama, M. Miyashita, T. Kondo, T. Yamada, K. Yazawa, R. Yoshikawa and H. Yamamoto.
J. Bacteriol., 198(11), 1585-1594, 2016年
- Application of freeze-dried powders of Genetically engineered microbial strains as adsorbents for rare earth metal ions
Moriwaki, H., Masuda, R., Yamazaki, Y., Horiuchi, K., Miyashita, M., Kasahara, J., Tanaka, T., and Yamamoto, H.
ACS Appl. Mater. Interfaces, 8(40), 26524-26531, 2016年 - 分泌シグナルに基づく細胞表層タンパク質のターゲティング機構の解明
山本博規
IFO Research Communications, 28, 132-133, 2014年 - A cell wall protein (YqgA) is genetically related to the cell wall-degrading DL-endopeptidases in Bacillus subtilis.
Hashimoto, M., K. Fujikura, Y. Miyake, Y. Higashitsuji, Y. Kiriyama, T. Tanaka, H. Yamamoto and J. Sekiguchi.
Biosci. Biotech. Biochem., 78(8), 1428-1434, 2014年 - Localization and expression of the Bacillus subtilis DL-endopeptidase LytF are influenced by mutations in LTA synthases and glycolipid anchor synthetic enzymes.
Kiriyama, Y., K. Yazawa, T. Tanaka, R. Yoshikawa, H. Yamane, M. Hashimoto, J. Sekiguchi, and H. Yamamoto.
Microbiology, 160, 2639-2649, 2014年 - Adsorption of rare earth ions onto the cell walls of wild type and lipoteichoic acid-defective strains of Bacillus subtilis
Moriwaki, H., R. Koide, R. Yoshikawa, Y. Warabino and H. Yamamoto
Appl. Microbiol. Biotech., 97(8), 3721-3728, 2013年
- Interactions of microorganisms with rare earth ions and their utilization for separation and environmental technology
Moriwaki, H., and H. Yamamoto
Appl. Microbiol. Biotech., 97(1), 1-8, 2013年 - バクテリアにおける細胞骨格蛋白質の機能解明
山本博規
倉田奨励金研究報告, 41, 47-49, 2011年 - 細菌細胞壁の合成・修飾・分解機構の解明
山本博規
財団法人長瀬科学技術振興財団研究報告集, 21, 89-96, 2010年 - バクテリアにおける細胞骨格蛋白質の機能解明
山本博規
倉田奨励金研究報告, 40, 99-101, 2010年 - 枯草菌における細胞の分離
橋本昌征，山本博規，関口順一
繊維学会誌, 65, 282-286, 2009年 - Identification and characterization of novel cell wall hydrolase CwlT: a two-domain autolysin exhibiting n-acetylmuramidase and DL-endopeptidase activities
Fukushima, T., Kitajima, T., H. Yamaguchi, Q. Ouyang, K. Furuhata, H. Yamamoto, T. Shida, and J. Sekiguchi
JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, 283(17), 11117-11125, 2008年 - Post-translational control of vegetative cell separation enzymes through a direct interaction with specific inhibitor IseA in Bacillus subtilis.
Yamamoto, H., M. Hashimoto, Y. Higashitsuji, H. Harada, N. Hariyama, L. Takahashi, T. Iwashita, S. Ooiwa and J. Sekiguchi.
Molecular Microbiology, 70(1), 168-182, 2008年 - The major and minor wall teichoic acids prevent the sidewall localization of vegetative DL-endopeptidase LytF in Bacillus subtilis.
Yamamoto, H., Y. Miyake, M. Hisaoka, S. Kurosawa and Junichi Sekiguchi.
Molecular Microbiology, 70(2), 297-310, 2008年 - Characterization of new L,D-endopeptidase gene product CwlK (previous YcdD) that hydrolyzes peptidoglycan in Bacillus subtilis
Fukushima, T; Yao, Y; Kitajima, T; Yamamoto, H; Sekiguchi, J
Molecular Genetics and Genomics, 278(4), 371-383, 2007年 - A new D,L-endopeptidase gene product, YojL (renamed CwlS), plays a role in cell separation with LytE and LytF in Bacillus subtilis
Fukushima, T., A. Afkham, S. Kurosawa, T. Tanabe, H. Yamamoto, and J. Sekiguchi.
J. Bacteriol., 188(15), 5541-5550, 2006年 - Functional analysis of the YvrGHb two component system of Bacillus subtilis: Identification of the regulated genes by DNA microarray and Northern blot analyses
Serizawa, M., K. Kodama, H. Yamamoto, K. Kobayashi, N. Ogasawara, and J. Sekiguchi.
Biosci. Biotechnol. Biochem., 59(11), 2155-2169, 2005年 - Systematic analysis of SigD-regulated genes in Bacillus subtilis by DNA microarray and Northern blotting analyses
Serizawa, M., H. Yamamoto, H. Yamaguchi, Y. Fujita, K. Kobayashi, N. Ogasawara, and J. Sekiguchi
GENE, 329, 125-136, 2004年 - Characterization of a new Bacillus subtilis peptidoglycan hydrolase gene, yvcE (named cwlO), and the enzymatic properties of its encoded protein
Yamaguchi, H., K. Furuhata, T. Fukushima, H. Yamamoto, and J. Sekiguchi
J. Biosci. Bioeng., 98(3), 174-181, 2004年 - Characterization of a polysaccharide deacetylase gene homologue (pdaB) on sporulation of Bacillus subtilis
Fukushima, T., T. Tanabe, H. Yamamoto, S. Hosoya, T. Sato, H. Yoshikawa and J. Sekiguchi
J. Biochemistry (Tokyo), 136(3), 283-291, 2004年 - Essential Bacillus subtilis genes
Kobayashi, K., T. Fukushima, S. Ishikawa, J. Sekiguchi, H. Yamamoto, N. Ogasawara （他93名）
Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 100(8), 4678-4683, 2003年 - Transcriptional, functional and cytochemical analyses of the veg gene in Bacillus subtilis
Fukushima, T., S. Ishikawa, H. Yamamoto, N. Ogasawara, and J. Sekiguchi
J. Biochemistry (Tokyo), 133(4), 475-483, 2003年 - Localization of vegetative cell wall hydrolases, LytC, LytE and LytF, on the Bacillus subtilis cell surface, and the stability of these enzymes to cell wall-bound or extracellular proteases
Yamamoto, H., S. Kurosawa, and J. Sekiguchi
J. Bacteriol., 185(22), 6666-6677, 2003年 - 枯草菌はどのように環境変化に適応するか ー細胞表層の蛋白質の転写を制御する二成分制御系が明らかにー
山本博規;関口順一
化学と生物, 40(12), 778-780, 2002年 - Production of long-chain levan by a sacC insertional mutant from Bacillus subtilis 327UH
Shida, T., K. Mukaijo, S. Ishikawa, H. Yamamoto, and J. Sekiguchi
Biosci. Biotechnol. Biochem., 66(7), 1555-1558, 2002年 - Simultaneous display of bacterial and fungal lipases on the cell surface of Bacillus subtilis
Kobayashi, G., K. Fujii, M. Serizawa, H. Yamamoto, and J. Sekiguchi
J. Biosci. Bioeng., 93(1), 15-19, 2002年 - Stabilization of cell wall proteins in Bacillus subtilis: a proteomic approach
Antelmann, H., H. Yamamoto, J. Sekiguchi, and M. Hecker
PROTEOMICS, 2(5), 591-602, 2002年 - A polysaccharide deacetylase gene (pdaA) is required for germination and for production of muramic _-lactam residues in the spore cortex of Bacillus subtilis
Fukushima, T., H. Yamamoto, A. Atrih, S. J. Foster, and J. Sekiguchi
J. Bacteriol., 184(21), 6007-6015, 2002年 - Regulation of the glv operon in Bacillus subtilis: YfiA (GlvR) is a positive regulator of the operon that is repressed through CcpA and cre
H. Yamamoto/ M. Serizawa/ J. Thompson / J. Sekiguchi
J. Bacteriol., 183(17), 5110-5121, 2001年 - Accumulation of an artificial cell wall-binding lipase by Bacillus subtilis wprA and/or sigD mutants
Kobayashi, G; Toida, J; Akamatsu, T; Yamamoto, H; Shida, T; Sekiguchi, J
FEMS Microbiol. Letters, 188(2), 165-169, 2000年 - The CitST two-component system regulates the expression of the Mg-citrate transporter in Bacillus subtilis.
Yamamoto, H; Murata, M; Sekiguchi, J
Molecular Microbiology, 37(4), 898-912, 2000年 - Accumulation of a Recombinant Aspergillus oryzae Lipase artificially Localized on the Bacillus subtilis Cell Surface
G. Kobayashi/J. Toida/T. Akamatsu/ H. Yamamoto/T. Shida / J. Sekiguchi
J. Biosci. Bioeng., 90, 422-425, 2000年 - 枯草菌ゲノムと遺伝子の特徴
小笠原直毅;定家義人;藤田昌也;吉田健一;藤田泰太郎;吉川博文;三輪泰彦;山本博規;関口順一;熊野みゆき;山根國男;村田麻喜子;大木玲子
蛋白質・核酸・酵素, 44(10), 1449-1459, 1999年 - 枯草菌のゲノムサイエンス
関口順一;山本博規
生物工学会誌, 77(9), 399-402, 1999年 - Crystallization and preliminary X-ray analysis of the 6-phospho-alpha-glucosidase from Bacillus subtilis
Varrot, A; Yamamoto, H; Sekiguchi, J; Thompson, J; Davies, GJ
ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION D-BIOLOGICAL CRYSTALLOGRAPHY, 55, 1212-1214, 1999年 - Characterization of a new sigma K-dependent cell wall hydrolase gene that plays a role in Bacillus subtilis mother cell lysis
Nugroho, FA; Yamamoto, H; Kobayashi, Y; Sekiguchi, J
Journal of Bacteriology, 181(20), 6230-6237, 1999年 - Production of a recombinant lipase artificially localized on the Bacillus subtilis cell surface
Tsuchiya, A; Kobayashi, G; Yamamoto, H; Sekiguchi, J
FEMS Microbiol Letters, 176(2), 373-378, 1999年 - Transcription of genes near the sspE locus of the Bacillus subtilis genome
Yamamoto, H., M. Mori, and J. Sekiguchi
Microbiology, 145, 2171-2180, 1999年 - The gene glvA of Bacillus subtilis 168encodes a metal-requiring, NAD (H)-dependent 6-phospho-alpha-glucosidase - Assignment to family 4 of the glycosylhydrolase superfamily
Thompson, J; Pikis, A; Ruvinov, SB; Henrissat, B; Yamamoto, H; Sekiguchi, J
JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, 273(42), 27347-27356, 1998年 - A 23.4 kb segment at the 69 degree to 70 degree region of the Bacillus subtilis genome
Yamamoto, H; Uchiyama, S; Nugroho, FA; Sekiguchi, J
Microbiology, 143(4), 1317-1320, 1997年 - Cloning and sequencing of a 35.7 kb in the 70 degree - 73 degree region of the Bacillus subtilis genome reveal genes for a new two-component system, three spore germination protein, an iron uptake system and a stress response protein
Hiroki Yamamoto;Shigeki Uchiyama;Fajar Aji Nugroho;Junichi Sekiguchi
GENE, 194(2), 191-199, 1997年 - The complete genome sequence of the Gram-positive bacterium Bacillus subtilis
Kunst, F; Ogasawara, N; Moszer, I; Albertini, AM; Alloni, G; Azevedo, V; Bertero, MG; Bessieres, P; Bolotin, A; Borchert, S; Borriss, R; Boursier, L; Brans, A; Braun, M; Brignell, SC; Bron, S; Brouillet, S; Bruschi, CV; Caldwell, B; Capuano, V; Carter, NM; Choi, SK; Codani, JJ; Connerton, IF; Cummings, NJ; Daniel, RA; Denizot, F; Devine, KM; Dusterhoft, A; Ehrlich, SD; Emmerson, PT; Entian, KD; Errington, J; Fabret, C; Ferrari, E; Foulger, D; Fritz, C; Fujita, M; Fujita, Y; Fuma, S; Galizzi, A; Galleron, N; Ghim, SY; Glaser, P; Goffeau, A; Golightly, EJ; Grandi, G; Guiseppi, G; Guy, BJ; Haga, K; Haiech, J; Harwood, CR; Henaut, A; Hilbert, H; Holsappel, S; Hosono, S; Hullo, MF; Itaya, M; Jones, L; Joris, B; Karamata, D; Kasahara, Y; KlaerrBlanchard, M; Klein, C; Kobayashi, Y; Koetter, P; Koningstein, G; Krogh, S; Kumano, M; Kurita, K; Lapidus, A; Lardinois, S; Lauber, J; Lazarevic, V; Lee, SM; Levine, A; Liu, H; Masuda, S; Mauel, C; Medigue, C; Medina, N; Mellado, RP; Mizuno, M; Moestl, D; Nakai, S; Noback, M; Noone, D; OReilly, M; Ogawa, K; Ogiwara, A; Oudega, B; Park, SH; Parro, V; Pohl, TM; Portetelle, D; Porwollik, S; Prescott, AM; Presecan, E; Pujic, P; Purnelle, B; Rapoport, G; Rey, M; Reynolds, S; Rieger, M; Rivolta, C; Rocha, E; Roche, B; Rose, M; Sadaie, Y; Sato, T; Scanlan, E; Schleich, S; Schroeter, R; Scoffone, F; Sekiguchi, J; Sekowska, A; Seror, SJ; Serror,P; Shin, BS; Soldo, B; Sorokin, A; Tacconi, E; Takagi, T; Takahashi, H; Takemaru, K; Takeuchi, M; Tamakoshi, A; Tanaka, T; Terpstra, P; Tognoni, A; Tosato, V; Uchiyama, S; Vandenbol, M; Vannier, F;Vassarotti, A; Viari, A; Wambutt, R; Wedler, E; Wedler, H; Weitzenegger, T; Winters, P; Wipat, A; Yamamoto, H; Yamane, K; Yasumoto, K; Yata, K; Yoshida, K; Yoshikawa, HF; Zumstein, E; Yoshikawa, H; Danchin, A
Nature, 390(6657), 249-256, 1997年 - Determination of a 12 kb nucleotide sequence around the 76 degrees region of the Bacillus subtilis chromosome
Yamamoto, H; Uchiyama, S; Fajar, AN; Ogasawara, N; Sekiguchi,J
MICROBIOLOGY-UK, 142, 1417-1421, 1996年 - Cloning and sequencing of a 40.6 kb segment in the 73 degree - 76 degree region of the Bacillus subtilis chromosome containing genes for trehalose metabolism and acetoin utilization
Hiroki Yamamoto;Shigeki Uchiyama;Junichi Sekiguchi
Microbiology, 142(11), 3057-3065, 1996年 - The Bacillus subtilis chromosome region near 78 degrees contains the genes encoding a new two-component system, three ABC transporters and a lipase
Yamamoto, H; Uchiyama, S; Sekiguchi, J
GENE, 181(1-2), 147-151, 1996年 - Cloning and sequencing of a 27.8-kb nucleotide sequence of the 79 degree - 81 degree region of the Bacillus subtilis genome containing the sspE locus
Hiroki Yamamoto;Shigeki Uchiyama;Junichi Sekiguchi
DNA Res., 3, 257-262, 1996年 - Nucleotide sequence and characterization of the large mitochondrial rRNA gene of Penicillium urticae, and its comparison with those of other filamentous fungi
Hiroki Yamamoto;Atsushi Naruse;TakeshiOhsaki;Junichi Sekiguchi
J. Biochem., 117(4), 888-896, 1995年 - Nucleotide sequence and regulation of a new putative cell wall hydrolase gene, cwlD, which affects germination in Bacillus subtilis
Junichi Sekiguchi;Kazumi Akeo;Hiroki Yamamoto;Fuat K. Khasanov;Juan C. Alonso;Akio Kuroda
J. Bacteriol., 177(19), 5582-5589, 1995年 - Nucleotide sequence of the large mitochondrial rRNA gene of Penicillium chrysogenum
Naruse, A., H. Yamamoto, and J. Sekiguchi.
Biochim. Biophys. Acta, 1172, 353-356, 1993年 - Transformation of Penicillium urticae with plasmids containing the hygromycin B resistance gene
Kiuchi, N., A. Naruse, H. Yamamoto, and J. Sekiguchi.
Agric. Biol. Chem., 55, 3053-3057, 1991年 - Autonomously replicating fragments of mitochondrial DNA from Penicillium urticae in Saccharomyces cerevisiae
Yamamoto, H., Y. Yoshida, Y. Kitamura, and J. Sekiguchi.
J. Ferment. Bioeng., 71, 275-277, 1991年 - CHARACTERIZATION AND COMPARISON OF MITOCHONDRIAL DNAS AND RIBOSOMAL-RNAS FROM PENICILLIUM-URTICAE AND PENICILLIUM-CHRYSOGENUM
Sekiguchi, J., T. Ohsaki, H. Yamamoto, K. Koichi, and T. Shida.
JOURNAL OF GENERAL MICROBIOLOGY, 136, 535-543, 1990年
書籍等出版物
- In: Neil D. Rawlings and Guy S. Salvesen, editors, Handbook of Proteolytic Enzymes, 3rd Edition.
Sekiguchi, J., and H. Yamamoto, Murein Peptidase LytF
Oxford: Academic Press, 2479-2482 2012年 - In: Y. Sadaie and K. Matsumoto, editors, The Frontiers of Molecular Microbiology Revisited
Sekiguchi, J., and H. Yamamoto, Cell wall structure of E. coli and B. subtilis
Kerala: Research Signpost, 115-148 2012年 - 応用生物科学入門
白井孝治、山本博規, バイオマスとその利用
オーム社, 第6章 135-157頁 2010年 - A Practical Manual, Chap. 5B, John Wiley&Sons
W. Schumann/S. D. Ehrlich /N. Ogasawara eds./ Yamamoto, H./K. Asai /K. Kobayashi, 共著, Northern Blot Analysis with non-RI Detection Systems; Functional Analysis of Bacterial Genes
41-44 2001年
共同研究・競争的資金等の研究課題
- 細菌細胞壁のテイコ酸修飾機構の解明および高温環境適応におけるテイコ酸の重要性
科学研究費補助金, 基盤研究(C)
2017年04月20日 - 2019年 - 枯草菌遺伝子操作株を滅菌・凍結乾燥させた粉体によるレアメタルの抽出法の開発
科学研究費補助金, 基盤研究(C)
2017年 - 2019年 - 細胞表層タンパク質のターゲティング機構の解明
発酵研究所
2012年 - 細菌細胞表層タンパク質のターゲティング機構の解明
科学研究費補助金, 基盤研究(C)
2011年 - 2013年 - 植物資源の有効利用に関する研究
受託研究, コンビ株式会社
2011年 - 2011年 - バクテリアにおける細胞表層修飾機構の解明
公益財団法人中部電気利用基礎研究振興財団
2011年 - 細菌細胞表層制御による細胞増殖，形態，機能維持メカニズムの解明
科学研究費補助金, 基盤研究(A)
2010年 - 2012年 - 細菌細胞壁の合成・修飾・分解機構の解明
財団法人長瀬科学技術振興財団
2009年 - バクテリアにおける細胞骨格蛋白質の機能解明
財団法人倉田記念日立科学技術財団
2009年 - 細菌の細胞表層ポリマーに関する研究
受託研究, コンビ株式会社
2008年 - 2011年 - 乳酸菌発酵液が植物の生育に及ぼす影響調査
受託研究, コンビ株式会社
2008年 - 2010年 - 細菌細胞の形を支配する新規表層蛋白質の解析
科学研究費補助金, 基盤研究(B)
2007年 - 2009年 - 細菌細胞壁のテイコ酸修飾における細胞骨格蛋白質の機能解明
科学研究費補助金, 基盤研究(C)
2007年 - 2009年 - 生ゴミ堆肥化過程における微生物の変動調査
受託研究, 上田市
2007年 - 2007年 - 枯草菌の細胞分離酵素の局在性と細胞壁修飾機構の解明
ホクト生物科学振興財団
2007年 - 微生物資源の有効利用
2007年 - 枯草菌の細胞表層修飾と細胞形態維持機構の研究
科学研究費補助金
2006年 - 細菌細胞の分離メカニズムとタイコイン酸の機能の研究
科学研究費補助金, 基盤研究(B)
2004年 - 2006年 - 細胞表層タンパク質の局在化機構の解明
科学研究費補助金
2003年 - 枯草菌細胞表層蛋白質の安定性及び局在性における分泌プロテアーゼの影響
科学研究費補助金, 若手研究(B)
2002年 - 2004年 - 細菌細胞表層の合成・修飾機構の研究
科学研究費補助金, 基盤研究(B)
2001年 - 2003年 - 細胞表層・細胞膜を介した環境との相互ネットワークの解析
科学研究費補助金, 特定領域研究(C)
2000年 - 2002年
